出任党主席对于江鹏坚是一项非常艰巨的任务。由于民进党是在党禁尚未开放前成立，属于不合法政党；而且民进党在党纲草案中明确主张“台湾的前途，应由台湾全体住民决定”，这两则因违反当时的法令，随时面临着被取缔的命运。此外，民进党草创初期不免百业待举，而且党内派系林立、人事紊乱复杂，在考验着江鹏坚的领导和协调能力。

 　　针对各界对民进党“自决”=“台独”的质疑，江鹏坚通过各种方式予以辩解、“消毒”。他说，民进党的“自决”主张，是一项程序而不是结果，是对人民选择意愿的高度尊重，“自决”和“独立”没有等号的关系；表示现在不是海峡两岸谈论统一或独立的时机，双方的政经差距太悬殊，目前还缺乏对谈的基础。

 　　针对党内运动路线上的矛盾。民进党从党外时期即存在着截然对立的两条路线之争，以“党外编辑作家联谊会”为代表的一派力主群众运动，认为在当时政治环境下，反对党只能走上街头、发动民众抗争予当局压力；而以“党外公政会”为代表的一派则主张议会路线，通过选举进入体制内来进行改革，双方路线之争延续到民进党成立之后。在这样情况下，江鹏坚则在双方之间尽力调合。他认为，民进党虽然有必要走群众路线，但所谓群众路线并不一定是狂飚型的街头政治，可以在群众运动中加入亲和力，并对整个运动做相当的规划。

 　　针对党内派系斗争，他充分发挥自身沉稳内敛的个性和圆融的处世原则，与各派系保持等距离，使党的机器得以正常运作。江鹏坚明确表示，民进党是反对势力的联盟，彼此尊重、说服、包容非常重要，党内应该尽量淡化派系斗争，否则对党的传统和发展均无益。 　　江鹏坚率领民进党打的一场选战是当年底的增额“立委”、增额“国代”改选。时值民进党成立不过2个月，又发生许信良化名偷渡闯关桃园机场的警民严重冲突，江鹏坚亲临冲突现场，背顶着警方的高压水龙头向民众发表演说，对外发表声明，表明民进党反对暴力的立场，最大限度地化解了一系列暴力冲突事件对民进党的负面影响，使得民进党在两项选举中取得亮丽的成绩：在增额“立委”选举中，民进党获得12席，比1983年的6席增加了一倍，且多位民进党籍候选人是以最高票当选；在增额“国代”选举中，民进党也获得了11席，比1983年的5席增加一倍。初战告捷，奠定了民进党的政治基础。