何天佐从1990年至1995年，历时五载，利用工作之余，撰写了100余万字的《何氏骨科学》，由中国中医古籍出版社出版(上卷1993年6月、下卷1995年12月)。这既是何氏骨科发展史上的第一本学术专著，又成为何氏骨科的当代学术标志。

何天佐根据何氏骨科历代祖传经验和自身临床实践探索，应用中医药学、现代医学和生物力学等相关学科，既阐释了何氏骨科学术思想及理法方药学术特色，又提出了"骨伤、骨病、先天骨疾患"的骨科疾病分类，以及"治骨先治肉"、"损伤一证，固从血论，更当重气"、"骨伤手法在先，骨病药物为主"、"分部位联合用药"、"联合外固定理论及方法"、"瞬间复位法"、"夹脊振抖法"等若干新的诊疗原理及方法。该专著被中外学者评价为"不囿经典、理论新颖"、"中西结合，技术独特"，荣获中国中医古籍出版社优秀科技图书一等奖，何天佐因之被聘为"中国中医研究院特色医药合作中心顾问"。

1992年，何天佐主持的"何氏骨科系列药品开发研究"课题，被国家科委列为"八五"星火计划项目。何天佐根据何氏祖传秘方，应用现代中医药研究成果，研制的"消肿镇痛膏"和"强腰壮骨膏"，经新药评审专家鉴定认为:何氏药膏采用现代高分子材料作粘合剂，生产工艺先进，消除了传统膏剂存放期短、使用不方便和橡胶膏剂易致敏等弊端，填补了中药制剂的有关空白。以"疗效显著、安全便捷"的特点，受到广大国内外、军内外病员的信赖和好评。尤其是经全军有关医疗单位使用证实，何氏膏药用于部队平时训练中发生的有关创伤，治疗及时、显效迅速，适用部队于平时或战时卫勤保障药品。2002年12月获得国家药品监督管理局颁发的新药批准文号，"消肿止痛膏――国药准字Z20026335"、"强腰壮骨膏――国药准字Z20025924"，并与地方制药企业技术合作，成立"四川厚生天佐药业有限公司"，联合开发，迄今投放市场五年多，畅销国内三十余个省市，近五年两个新药累计创产值近3000万元。这既是何氏骨科祖传方药首次获得国家新药批准文号，又成为何氏骨科专方专药迈上产业化发展平台的标志。

何天佐根据祖传秘方研制的"消肿止痛膏"、"强腰壮骨膏"、"风湿痹痛膏"，分别于1999年7月2日、30日和2000年6月2日获国家知识产权局颁发的发明专利证书。这是何氏骨科首次获得知识产权专利。

2006年，何天佐与解放军三医大第一附属医院(西南医院)关节外科中心，联合开展"用于治疗骨关节病的雷公藤内酯醇与透明质酸复合制剂的研发"，并申报了全军医药卫生基金科研课题。先后获得成都军区授予的"科技兴医先进个人"、"优秀科技干部"、"医学科技先进个人"等荣誉称号。