1966年中央发出的“五·一六”通知，引发了一场“文化大革命”。这场大革命波及到每一个角落，我单位也不例外，由此带来了正规的组织构架由新兴的领导形式所替代的局面。1968年8月21日，遵照中共中央、国务院、中央军委、中央文革的批示，对中国医学科学院实行军事管制，成立了军事管制委员会，刘景晏同志为主任，蒋述生同志为副主任。1968年12月30日，卫生部军管会批示同意中国医学科学院成立革命委员会，由刘景晏同志任主任，曹荫槐、蒋述生、黄乎三位同志任副主任。1969年3月22日，经上级党委批准，成立中国共产党中国医学科学院核心小组，由刘景晏、曹荫槐、蒋述生、黄乎、李震（暂缺两名）七同志组成，刘景晏同志担任组长。1970年2月23日，卫生部军管会批准同意增补苏博一、周希敏两同志为中国医学科学院党核心小组成员。
　　1971年1月，卫生部军管会通知，遵照国务院指示，决定由新进驻中国医学科学院军管会主任李朴群同志担任中国医学科学院党核心小组组长，军管会副主任刘强同志任副组长。同年1月22日卫生部军管会同意增补吴阶平同志为中国医学科学院党核心小组成员。3月6日卫生部军管会同意增补黄乎同志为中国医学科学院党核心小组副组长，孙辉同志为党核心小组成员。
　　根据中央[1970]57号文件，关于召开地方各级党代会的通知精神，医科院党核心小组决定召开中国医学科学院第四届党代表大会，为此成立了党代会筹备小组，由刘强、林伟、孙辉、李子和、苏文五同志组成，负责各项筹备工作。1972年10月28日，发出筹备党代会的通知，12月9日医科院党核心组召开各单位党核心小组正、副组长和院直各部门负责人的核心组扩大会议进行了部署。
　　1973年5月15日至17日，中国医学科学院第四届党代表大会正式召开。大会正式代表219人，到会代表199人，列席代表75人。会上，李朴群同志致开幕词，卫生部军管会副主任闫钧同志作了重要讲话，黄乎同志代表党核心小组作了工作报告。大会选举出第四届党委委员三十七名同志（暂空五名），分别为方圻、王子石、王秀华、白希清、朱解、刘学喜、李冰、李震、李子和、李春阳、李钟勋、陈书涟、陈仲武、陈克铨、苏文、杨纯、余宏迢、陆宗良、吴阶平、林伟、范文起、高岚、高守一、顾方舟、黄乎、黄家驷、章央芬、崔静宜、温坚、董炳琨、蒲澄、薛久清同志。1973年6月6日，卫生部军管会批复同意杨纯同志为党委书记，黄乎、蒲澄、白希清、李钟勋四同志为党委副书记。白希清、李子和、李钟勋、苏文、杨纯、吴阶平、林伟、黄乎、黄家驷、蒲澄十一名同志（暂空一名）为党委常委。
　　1973年6月，根据中央“凡是实行军管的地方和单位，在党委建立后，军管即可撤消”的规定，卫生部[1973]卫军管办字第11号文通知，撤消中国医学科学院军事管制委员会。1973年8月8日卫生部批复同意刘强同志为中国医学科学院党委副书记。1974年1月4日卫生部同意增补马玉英、齐涛、任广同志为医科院党委委员，增补党委委员高岚、马玉英同志为院常委委员。因董炳琨同志调离我院，免去其院党委委员职务。1974年8月5日，医科院党委常委会研究决定任高岚同志为院党委副书记，并经卫生部批示同意。
　　1975年是我国国民经济第四个五年计划的最后一年，也是密切衔接1976至1985年（第五个和第六个五年）国民经济发展远景规划的关键一年。为此，医科院党委于1975年9月16日和10月14日分别召开了由院党委常委、各单位党委书记和机关部分处室负责人参加的党委扩大会议，讨论拟定了《中国医学科学院事业规划（草案）》（1976年—1985年），以国家计委提出的十年规划的设想和目标为依据，实行老中青，医教研，领导、群众和科技人员，研究、生产和使用等三结合，树立全院“一盘棋”的观点，全面规划，统筹安排我院科研、医疗、教学等各项工作。
　　1976年10月粉碎“四人帮”，结束了长达十年的“文化大革命”，党组织发展走入正轨。我院所属各单位纷纷要求增设或调整党的基层组织，为此，医科院党委向卫生部提出了“关于增设或撤消党的基层组织批准权限的请示报告”，卫生部于1978年3月14日批复同意。即：
　　1、医科院所属各院所党委下面要增设党总支或支部，可由各院所党委决定，报医科院党委批准；设党总支的报卫生部政治部备案。2、各院所党委下属总支要增设党的支部，可由党总支决定，报该院所党委批准，向医科院政治部备案。3、医科院若要增设或调整院所一级的党委、总支、包括设立院直总支，由医科院党委决定，报卫生部党组或政治部批准。4、撤消或合并党的基层组织，其批准权限同上。
　　1978年4月5日经卫生部党组研究决定，中国医学科学院党委常委由王伟等十五名同志组成。王伟同志兼党委书记，齐涛、黄乎、白希清、蒲澄、高岚五同志为党委副书记，黄家驷、沈其震、方志西、吴阶平、邓家栋、李子和、顾方舟、吴征鉴、马玉英九同志为党委常委。同年7月15日卫生部党组批复同意增补章央芬同志为医科院党委常委。
　　1978年12月党的十一届三中全会决定，把全党工作的重点转移到社会主义现代化建设上来。根据三中全会精神，我院党委对今后工作的重点进行了调整，在抓好思想转变的基础上，明确指出科学研究是我们工作的中心任务，据此制订出“定方向、定任务、定人员、定设备、定制度”的五定措施，以科研工作带动其他各项工作的开展。
　　1979年10月27日，卫生部[79]卫党字第101号文通知，任命林士笑同志为卫生部党组成员、中国医学科学院党委书记，免去王伟同志兼任的中国医学科学院党委书记职务。
　　为了加强院直机关党的工作和对各支部的领导，1979年11月26日院党委常委会决定恢复院直机关党总支，同意由成哲忠、刘学喜、李介祚、卢诚、高德馨、赵林、李华清七人组成院直机关总支委员会，成哲忠、刘学喜同志任总支副书记。1979年统计党员总数共计1952人，占全院总人数的29.9%。（作者：王京燕）